基因组水平的改动是肿瘤产生、开展的重要始动要素，对此，南通大学医学院本科生团队近来自主研发了一款高效的DNA调控元件及超增强子挑选渠道——SPACE，有助于发现新的DNA调控元件，从而调控肿瘤的分子机制，为肿瘤的精准医治供给潜在的新方法。该效果近期宣布在《我国免疫学杂志》（英文版）上。

研讨发现，肿瘤在基因组层面的改动大部分产生在非编码DNA。提醒非编码DNA在肿瘤中的效果，有助于了解肿瘤的产生、开展规律亚博VIP888，从而研制出确诊和医治肿瘤的有用战略。可是，由于非编码DNA不编码蛋白质，虽然其数量在基因组中占98%以上，却曾一度被认为是“废物”DNA，其功用也被忽视。跟着研讨的不断深化，人们发亚博VIP888现非编码DNA并非“废物”，而是蕴含着很多的DNA调控元件。但对非编码DNA在肿瘤中亚博VIP888的知道缺乏，在必定程度上阻止了非编码DNA在肿瘤确诊、医治和防备中的使用。怎么体系、高效地了解这些非编码DNA在肿瘤中的功用？这是现在肿瘤研讨领域中的难点问题。

为了处理这一难点，南通大学医学院本科生团队经过剖析整合23种肿瘤的404个患者的ATAC测序数据、基因表达数据及肿瘤患者的临床数据，自主开发了一款高效的DNA调控元件及超增强子挑选渠道——SPACE。该渠道将DNA调控元件的功用状况和肿瘤的基因表达谱及预后等临床数据进行相关，使研讨者能够快速地发掘潜在的重要DNA调控元件。该渠道包含了562709个DNA调控元件，可快速精确地获取候选DNA调控元件与基因表达及患者预后等参数的相关性，并可辨别重要的DNA调控元件。凭借该渠道进行挑选，可发现很多能够猜测肿瘤患者预后的DNA调控元件。

SPACE渠道不只有助于发现新的DNA调控元件，进行多种下流的调控机制剖析，并且有助于论述重要非编码DNA的功用及其调控肿瘤的分子机制，为深化了解基因的精准调控及肿瘤内要害基因的反常活化供给了新思路，也为肿瘤的精准医治供给了新方法。